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当商检报关与别克配套厂家不一致时，涉及到商检和海关的操作和规定，具体处理方式如下：
1、商检报关：在进出口业务中，商检是对商品进行检验以符合相关规定和标准的环节，如果商检报关的厂家与实际的别克配套厂家不一致，那么需要提供相关的证明文件来说明这种不一致的原因，例如合同、授权书等，商检机构会根据提供的资料进行审核，以确保商品的质量和安全符合标准。
2、海关处理：在海关处理时，需要提供准确的报关信息，包括商品信息、厂家信息、贸易合同等，如果商检报关的厂家与海关记录的厂家不一致，海关可能会要求提供额外的证明文件来解释这种不一致的原因，如果无法提供充分的证明文件，可能会导致海关对商品进行扣留或退运。
为了确保进出口业务的顺利进行，商检和海关的信息应该保持一致，如果在实际操作中出现了不一致的情况，应该及时与相关部门沟通并解释原因，同时提供相关的证明文件，这样可以避免不必要的延误和损失。